Né à Lanteira, dans la province de Grenade, le 9 août 1869, orphelin de mère très jeune, élève intelligent et très pieux, il étudia le droit, la philosophie et les lettres à Grenade et entra au séminaire de la même ville. Ordonné prêtre en 1891, il fut curé du sanctuaire de Guadix et chanoine de l’abbaye du Sacromonte de Grenade.
Nommé directeur adjoint d’école en 1895, il commença d’enseigner la métaphysique en 1896 au collège du Sacromonte, dont il fut nommé recteur en 1901. Durant ces années, il obtint ses diplômes dans les différentes matières qu’il étudiait. Il écrivit ensuite plusieurs ouvrages.
Le 14 décembre 1925, il fut nommé évêque auxiliaire de Grenade, puis, le 30 novembre 1928, évêque de Guadix. Au début de la guerre civile, il fut arrêté dans son palais épiscopal le 27 juillet 1936 ; il fut emprisonné à Almeria.
Manuel Medina Olmos fut transféré sur deux navires prisons. Le 30 août 1936, il fut transporté au ravin de los Chismes à Vicar, dans la province d’Almeria, où il fut exécuté avec 16 personnes, prêtres et laïcs. Il fut béatifié par Jean-Paul II le 10 octobre 1993.