Il naquit à Madrid vers 1070, dans une pauvre famille très chrétienne. Particulièrement pieux, humble et charitable dès son enfance, il se mit au service d’un riche propriétaire terrien qui fut bientôt impressionné par ses vertus. Tous les jours, il assistait à la messe avant de travailler, et partageait ses maigres revenus ainsi que ses repas avec les pauvres.

Il se maria avec Maria Toribia, qui lui donna un fils : ce dernier fut miraculeusement sauvé par les prières de ses parents alors qu’il était tombé dans un puits profond. Après cet événement, Isidore fit avec sa femme vœu d’abstinence.

Isidore fut accusé par d’autres ouvriers de ne pas assez travailler : son maître l’espionna et découvrit que, alors qu’il était en prières, deux anges faisaient travailler les bœufs à sa place. Il mourut à Madrid vers le 15 mai 1130. Canonisé par Benoît XIII le 4 juin 1725, il est saint patron de Madrid et des agriculteurs.