Né dans la première moitié du XVIIe siècle dans le Breconshire, au Pays de Galles, dans une famille demeurée fidèle au catholicisme, il sentit très jeune l’appel au sacerdoce. Il partit donc sur le continent pour faire ses études, d’abord à Gand, puis à Valladolid. Ordonné prêtre, il fut envoyé au Pays de Galles en 1654 ; il y exerça clandestinement son ministère durant de nombreuses années. Mais, traqué par les autorités, il fut finalement arrêté le 20 novembre 1678 et emprisonné à Cardiff.
Jugé sommairement le 5 mai 1679, Jean Lloyd fut reconnu coupable de trahison pour avoir exercé son sacerdoce, et condamné à mort. Il fut exécuté près de Cardiff le 22 juillet 1679, après avoir prononcé ces mots : « Je n’ai jamais été un bon orateur. Je dirai seulement que je meurs dans la vraie foi catholique et apostolique, selon ces mots du Credo : je crois en la sainte Eglise catholique ; et avec ces trois vertus : la foi, l’espérance et la charité. » Béatifié par Pie XI le 15 décembre 1929, il fut canonisé par Paul VI le 25 octobre 1970.