Né à Llanelidan, au Pays de Galles, il fut baptisé dans l’église anglicane, avant de voyager en Europe. C’est au cours de ses voyages qu’il se convertit au catholicisme. Reçu dans l’Eglise en 1587, à Reims, il fut ordonné prêtre le 11 juin 1588, et s’embarqua pour l’Angleterre en décembre de la même année, pour y exercer son ministère.

En 1590, il fut arrêté par le chasseur de prêtres Richard Topcliffe, qui se faisait passer pour un catholique pour les débusquer. Enfermé et torturé à la Tour de Londres, il se défendit courageusement et avec éloquence devant ses juges, mais fut reconnu coupable de haute trahison et condamné à mort. Il fut exécuté le 6 mai 1590 en compagnie d’un autre prêtre, Anthony Middleton ; ils subirent le sort réservé aux prêtres catholiques : pendaison, éviscération et écartèlement.

Edward Jones fut béatifié par Pie XI le 15 décembre 1929, en compagnie d’Anthony Middleton et de 105 autres martyrs anglais et gallois.